Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K2

SIK3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK3Q9Y2K2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIK3Q9Y2K2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SIK3Q9Y2K2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SIK3Q9Y2K2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIK3Q9Y2K2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIK3Q9Y2K2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SIK3Q9Y2K2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIK3Q9Y2K2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIK3Q9Y2K2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIK3Q9Y2K2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIK3Q9Y2K2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SIK3Q9Y2K2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SIK3Q9Y2K2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIK3Q9Y2K2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms