Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GINS2Q9Y248 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GINS2Q9Y248 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GINS2Q9Y248 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GINS2Q9Y248 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GINS2Q9Y248 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GINS2Q9Y248 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GINS2Q9Y248 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GINS2Q9Y248 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GINS2Q9Y248 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GINS2Q9Y248 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GINS2Q9Y248 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GINS2Q9Y248 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GINS2Q9Y248 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GINS2Q9Y248 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GINS2Q9Y248 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GINS2Q9Y248 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GINS2Q9Y248 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GINS2Q9Y248 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GINS2Q9Y248 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GINS2Q9Y248 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GINS2Q9Y248 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GINS2Q9Y248 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GINS2Q9Y248 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GINS2Q9Y248 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GINS2Q9Y248 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GINS2Q9Y248 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GINS2Q9Y248 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GINS2Q9Y248 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GINS2Q9Y248 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GINS2Q9Y248 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GINS2Q9Y248 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GINS2Q9Y248 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GINS2Q9Y248 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GINS2Q9Y248 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GINS2Q9Y248 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GINS2Q9Y248 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GINS2Q9Y248 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GINS2Q9Y248 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms