Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQG0

ERVK-11, Endogenous retrovirus group K member 11 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-11Q9UQG0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-11Q9UQG0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVK-11Q9UQG0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVK-11Q9UQG0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVK-11Q9UQG0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVK-11Q9UQG0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVK-11Q9UQG0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVK-11Q9UQG0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-11Q9UQG0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-11Q9UQG0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-11Q9UQG0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-11Q9UQG0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-11Q9UQG0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-11Q9UQG0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-11Q9UQG0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-11Q9UQG0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-11Q9UQG0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-11Q9UQG0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-11Q9UQG0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-11Q9UQG0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-11Q9UQG0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-11Q9UQG0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-11Q9UQG0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-11Q9UQG0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-11Q9UQG0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-11Q9UQG0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-11Q9UQG0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-11Q9UQG0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-11Q9UQG0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-11Q9UQG0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-11Q9UQG0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-11Q9UQG0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-11Q9UQG0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-11Q9UQG0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVK-11Q9UQG0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms