Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCTN4Q9UJW0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms