Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB7

AFF4, AF4/FMR2 family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF4Q9UHB7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
AFF4Q9UHB7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFF4Q9UHB7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms