Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC7

GALP, Galanin-like peptide, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALPQ9UBC7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms