Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms