Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
MBD5Q9P267 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
MBD5Q9P267 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
MBD5Q9P267 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
MBD5Q9P267 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
MBD5Q9P267 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
MBD5Q9P267 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
MBD5Q9P267 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
MBD5Q9P267 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
MBD5Q9P267 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
MBD5Q9P267 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
MBD5Q9P267 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
MBD5Q9P267 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
MBD5Q9P267 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
MBD5Q9P267 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
MBD5Q9P267 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
MBD5Q9P267 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
MBD5Q9P267 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
MBD5Q9P267 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
MBD5Q9P267 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC32.55■■■□□ 2.8
MBD5Q9P267 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
MBD5Q9P267 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
MBD5Q9P267 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
MBD5Q9P267 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms