Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN3Q9P232 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms