Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms