Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNRD1Q9P1U0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRD1Q9P1U0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRD1Q9P1U0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRD1Q9P1U0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRD1Q9P1U0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRD1Q9P1U0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRD1Q9P1U0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRD1Q9P1U0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRD1Q9P1U0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRD1Q9P1U0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRD1Q9P1U0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRD1Q9P1U0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRD1Q9P1U0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRD1Q9P1U0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRD1Q9P1U0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRD1Q9P1U0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRD1Q9P1U0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRD1Q9P1U0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRD1Q9P1U0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRD1Q9P1U0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms