Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms