Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP5Q9NZZ3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms