Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZG7

NINJ2, Ninjurin-2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINJ2Q9NZG7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NINJ2Q9NZG7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NINJ2Q9NZG7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NINJ2Q9NZG7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NINJ2Q9NZG7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NINJ2Q9NZG7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NINJ2Q9NZG7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NINJ2Q9NZG7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NINJ2Q9NZG7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NINJ2Q9NZG7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NINJ2Q9NZG7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NINJ2Q9NZG7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NINJ2Q9NZG7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NINJ2Q9NZG7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NINJ2Q9NZG7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NINJ2Q9NZG7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NINJ2Q9NZG7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NINJ2Q9NZG7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NINJ2Q9NZG7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NINJ2Q9NZG7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NINJ2Q9NZG7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NINJ2Q9NZG7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NINJ2Q9NZG7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NINJ2Q9NZG7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NINJ2Q9NZG7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NINJ2Q9NZG7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NINJ2Q9NZG7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NINJ2Q9NZG7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NINJ2Q9NZG7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NINJ2Q9NZG7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NINJ2Q9NZG7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NINJ2Q9NZG7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NINJ2Q9NZG7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NINJ2Q9NZG7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NINJ2Q9NZG7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NINJ2Q9NZG7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NINJ2Q9NZG7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NINJ2Q9NZG7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NINJ2Q9NZG7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NINJ2Q9NZG7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NINJ2Q9NZG7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NINJ2Q9NZG7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NINJ2Q9NZG7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NINJ2Q9NZG7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms