Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNK4Q9NYG8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms