Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCM9Q9NXL9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCM9Q9NXL9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCM9Q9NXL9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCM9Q9NXL9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCM9Q9NXL9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCM9Q9NXL9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCM9Q9NXL9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCM9Q9NXL9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCM9Q9NXL9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCM9Q9NXL9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCM9Q9NXL9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MCM9Q9NXL9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MCM9Q9NXL9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCM9Q9NXL9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCM9Q9NXL9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCM9Q9NXL9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCM9Q9NXL9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCM9Q9NXL9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCM9Q9NXL9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCM9Q9NXL9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCM9Q9NXL9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCM9Q9NXL9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCM9Q9NXL9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCM9Q9NXL9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCM9Q9NXL9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MCM9Q9NXL9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCM9Q9NXL9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCM9Q9NXL9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms