Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms