Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms