Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS98

SEMA3G, Semaphorin-3G, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3GQ9NS98 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3GQ9NS98 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3GQ9NS98 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms