Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms