Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS4Q9NRS4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS4Q9NRS4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS4Q9NRS4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS4Q9NRS4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS4Q9NRS4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS4Q9NRS4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS4Q9NRS4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS4Q9NRS4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMPRSS4Q9NRS4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMPRSS4Q9NRS4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMPRSS4Q9NRS4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS4Q9NRS4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms