Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TULP4Q9NRJ4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TULP4Q9NRJ4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TULP4Q9NRJ4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TULP4Q9NRJ4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TULP4Q9NRJ4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TULP4Q9NRJ4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TULP4Q9NRJ4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TULP4Q9NRJ4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TULP4Q9NRJ4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TULP4Q9NRJ4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TULP4Q9NRJ4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TULP4Q9NRJ4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TULP4Q9NRJ4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
TULP4Q9NRJ4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
TULP4Q9NRJ4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
TULP4Q9NRJ4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.4
TULP4Q9NRJ4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC30■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC30■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TULP4Q9NRJ4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms