Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms