Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms