Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB11FIP5Q9BXF6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms