Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SALL3Q9BXA9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms