Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SSBP3Q9BWW4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP3Q9BWW4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP3Q9BWW4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP3Q9BWW4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP3Q9BWW4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP3Q9BWW4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP3Q9BWW4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP3Q9BWW4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP3Q9BWW4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP3Q9BWW4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP3Q9BWW4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP3Q9BWW4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP3Q9BWW4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP3Q9BWW4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP3Q9BWW4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP3Q9BWW4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP3Q9BWW4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP3Q9BWW4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP3Q9BWW4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP3Q9BWW4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP3Q9BWW4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP3Q9BWW4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP3Q9BWW4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP3Q9BWW4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP3Q9BWW4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP3Q9BWW4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP3Q9BWW4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP3Q9BWW4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP3Q9BWW4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP3Q9BWW4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP3Q9BWW4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP3Q9BWW4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP3Q9BWW4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP3Q9BWW4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP3Q9BWW4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP3Q9BWW4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP3Q9BWW4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP3Q9BWW4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP3Q9BWW4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP3Q9BWW4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP3Q9BWW4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP3Q9BWW4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP3Q9BWW4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms