Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIOK2Q9BVS4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIOK2Q9BVS4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIOK2Q9BVS4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIOK2Q9BVS4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIOK2Q9BVS4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIOK2Q9BVS4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIOK2Q9BVS4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIOK2Q9BVS4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RIOK2Q9BVS4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIOK2Q9BVS4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIOK2Q9BVS4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIOK2Q9BVS4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIOK2Q9BVS4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIOK2Q9BVS4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIOK2Q9BVS4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIOK2Q9BVS4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RIOK2Q9BVS4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RIOK2Q9BVS4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RIOK2Q9BVS4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIOK2Q9BVS4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIOK2Q9BVS4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIOK2Q9BVS4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIOK2Q9BVS4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIOK2Q9BVS4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIOK2Q9BVS4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIOK2Q9BVS4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIOK2Q9BVS4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RIOK2Q9BVS4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RIOK2Q9BVS4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIOK2Q9BVS4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms