Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MTA3Q9BTC8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTA3Q9BTC8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTA3Q9BTC8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms