Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GINS3Q9BRX5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms