Protein–RNA interactions for Protein: Q96SM3

CPXM1, Probable carboxypeptidase X1, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPXM1Q96SM3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPXM1Q96SM3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms