Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSPG4P5Q96PW8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CSPG4P5Q96PW8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms