Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC43Q96MW1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC43Q96MW1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC43Q96MW1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC43Q96MW1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC43Q96MW1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC43Q96MW1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC43Q96MW1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC43Q96MW1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC43Q96MW1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC43Q96MW1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC43Q96MW1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC43Q96MW1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC43Q96MW1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC43Q96MW1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC43Q96MW1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC43Q96MW1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC43Q96MW1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC43Q96MW1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC43Q96MW1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC43Q96MW1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC43Q96MW1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC43Q96MW1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC43Q96MW1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC43Q96MW1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC43Q96MW1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC43Q96MW1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC43Q96MW1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC43Q96MW1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC43Q96MW1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC43Q96MW1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC43Q96MW1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC43Q96MW1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC43Q96MW1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC43Q96MW1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC43Q96MW1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC43Q96MW1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC43Q96MW1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC43Q96MW1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC43Q96MW1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC43Q96MW1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC43Q96MW1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms