Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FAM227BQ96M60 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms