Protein–RNA interactions for Protein: Q96M19

LINC00477, Putative transmembrane protein encoded by LINC00477, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00477Q96M19 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00477Q96M19 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00477Q96M19 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00477Q96M19 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00477Q96M19 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00477Q96M19 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00477Q96M19 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00477Q96M19 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00477Q96M19 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00477Q96M19 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00477Q96M19 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00477Q96M19 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00477Q96M19 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00477Q96M19 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00477Q96M19 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00477Q96M19 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00477Q96M19 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00477Q96M19 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00477Q96M19 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00477Q96M19 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00477Q96M19 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00477Q96M19 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00477Q96M19 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00477Q96M19 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00477Q96M19 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00477Q96M19 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00477Q96M19 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00477Q96M19 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00477Q96M19 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00477Q96M19 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00477Q96M19 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00477Q96M19 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00477Q96M19 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00477Q96M19 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00477Q96M19 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00477Q96M19 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00477Q96M19 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00477Q96M19 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms