Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW4

PRIMPOL, DNA-directed primase/polymerase protein, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIMPOLQ96LW4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRIMPOLQ96LW4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRIMPOLQ96LW4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRIMPOLQ96LW4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRIMPOLQ96LW4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRIMPOLQ96LW4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRIMPOLQ96LW4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRIMPOLQ96LW4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRIMPOLQ96LW4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRIMPOLQ96LW4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRIMPOLQ96LW4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRIMPOLQ96LW4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRIMPOLQ96LW4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRIMPOLQ96LW4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRIMPOLQ96LW4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRIMPOLQ96LW4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRIMPOLQ96LW4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRIMPOLQ96LW4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRIMPOLQ96LW4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRIMPOLQ96LW4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRIMPOLQ96LW4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PRIMPOLQ96LW4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRIMPOLQ96LW4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRIMPOLQ96LW4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRIMPOLQ96LW4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms