Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CRELD1Q96HD1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CRELD1Q96HD1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CRELD1Q96HD1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRELD1Q96HD1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CRELD1Q96HD1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRELD1Q96HD1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRELD1Q96HD1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRELD1Q96HD1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRELD1Q96HD1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms