Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEIL1Q96FI4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms