Protein–RNA interactions for Protein: Q96F07

CYFIP2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP2Q96F07 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CYFIP2Q96F07 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYFIP2Q96F07 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYFIP2Q96F07 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYFIP2Q96F07 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYFIP2Q96F07 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYFIP2Q96F07 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYFIP2Q96F07 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYFIP2Q96F07 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYFIP2Q96F07 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYFIP2Q96F07 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYFIP2Q96F07 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYFIP2Q96F07 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CYFIP2Q96F07 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYFIP2Q96F07 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYFIP2Q96F07 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYFIP2Q96F07 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYFIP2Q96F07 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYFIP2Q96F07 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CYFIP2Q96F07 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYFIP2Q96F07 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYFIP2Q96F07 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYFIP2Q96F07 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYFIP2Q96F07 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYFIP2Q96F07 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYFIP2Q96F07 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYFIP2Q96F07 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYFIP2Q96F07 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYFIP2Q96F07 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYFIP2Q96F07 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYFIP2Q96F07 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYFIP2Q96F07 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYFIP2Q96F07 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYFIP2Q96F07 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYFIP2Q96F07 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYFIP2Q96F07 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYFIP2Q96F07 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYFIP2Q96F07 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYFIP2Q96F07 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYFIP2Q96F07 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYFIP2Q96F07 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYFIP2Q96F07 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYFIP2Q96F07 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYFIP2Q96F07 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms