Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH8

NEURL3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL3Q96EH8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEURL3Q96EH8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEURL3Q96EH8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEURL3Q96EH8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms