Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RUNDC1Q96C34 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RUNDC1Q96C34 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RUNDC1Q96C34 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms