Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKD2Q969F2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms