Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP13Q92995 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP13Q92995 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP13Q92995 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP13Q92995 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP13Q92995 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP13Q92995 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP13Q92995 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP13Q92995 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP13Q92995 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP13Q92995 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP13Q92995 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP13Q92995 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP13Q92995 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP13Q92995 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP13Q92995 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP13Q92995 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP13Q92995 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP13Q92995 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP13Q92995 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP13Q92995 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP13Q92995 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP13Q92995 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP13Q92995 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP13Q92995 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP13Q92995 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
USP13Q92995 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP13Q92995 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP13Q92995 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP13Q92995 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP13Q92995 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
USP13Q92995 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP13Q92995 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP13Q92995 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP13Q92995 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP13Q92995 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP13Q92995 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP13Q92995 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP13Q92995 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP13Q92995 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP13Q92995 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP13Q92995 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP13Q92995 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP13Q92995 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP13Q92995 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP13Q92995 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP13Q92995 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP13Q92995 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP13Q92995 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP13Q92995 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP13Q92995 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP13Q92995 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP13Q92995 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP13Q92995 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP13Q92995 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP13Q92995 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP13Q92995 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP13Q92995 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP13Q92995 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP13Q92995 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP13Q92995 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP13Q92995 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP13Q92995 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP13Q92995 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP13Q92995 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP13Q92995 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP13Q92995 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP13Q92995 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP13Q92995 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP13Q92995 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP13Q92995 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP13Q92995 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP13Q92995 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP13Q92995 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP13Q92995 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP13Q92995 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP13Q92995 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP13Q92995 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP13Q92995 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP13Q92995 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP13Q92995 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP13Q92995 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP13Q92995 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP13Q92995 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP13Q92995 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP13Q92995 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP13Q92995 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP13Q92995 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP13Q92995 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP13Q92995 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP13Q92995 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP13Q92995 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP13Q92995 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP13Q92995 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP13Q92995 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP13Q92995 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP13Q92995 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP13Q92995 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP13Q92995 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP13Q92995 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms