Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3AQ92664 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3AQ92664 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms