Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCOLN3Q8TDD5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCOLN3Q8TDD5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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