Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAU0

NKX2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-3Q8TAU0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKX2-3Q8TAU0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NKX2-3Q8TAU0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NKX2-3Q8TAU0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NKX2-3Q8TAU0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NKX2-3Q8TAU0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NKX2-3Q8TAU0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NKX2-3Q8TAU0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NKX2-3Q8TAU0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NKX2-3Q8TAU0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NKX2-3Q8TAU0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms