Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAAF3Q8N9W5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms