Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDDC3Q8N4P3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDDC3Q8N4P3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDDC3Q8N4P3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDDC3Q8N4P3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDDC3Q8N4P3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDDC3Q8N4P3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDDC3Q8N4P3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDDC3Q8N4P3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDDC3Q8N4P3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
HDDC3Q8N4P3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HDDC3Q8N4P3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDDC3Q8N4P3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
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