Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms