Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NME8Q8N427 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME8Q8N427 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
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